С июня 1991 по июнь 1996 г. был юридическим экспертом комитета по внешним связям (КВС) мэрии Санкт-Петербурга. Прошел стажировку в Швеции по вопросам местного самоуправления.

　　9 ноября 1999 был назначен заместителем руководителя Аппарата Правительства РФ (руководитель Аппарата - Д.Козак). 11 января 2000 был освобожден от должности, так как 31 декабря 1999 указом и.о. президента В.Путина был назначен заместителем руководителя Администрации Президента РФ (руководитель Администрации - Александр Волошин).

　　15 февраля 2000 Дмитрий Медведев возглавил предвыборный штаб В.Путина.

　　3 июня 2000 указом президента В.Путина был назначен первым заместителем руководителя Администрации Президента РФ.

　　30 июня 2000 на годовом собрании акционеров ОАО "Газпром" был избран председателем совета директоров компании вместо Виктора Черномырдина.

　　В апреле 2001 года стал руководителем созданной по указанию президента В.Путина рабочей группы по либерализации рынка акций "Газпром".

　　В октябре 2002 г. был назначен представителем президента в Национальном банковском совете (НБС).

　　30 октября 2003 был назначен руководителем Администрации Президента РФ, сменив подавшего в отставку А.Волошина.

　　В апреле 2004 был назначен членом Совета безопасности РФ.

　　14 ноября 2005 сообщено о назначении Медведева первым заместителем Председателя Правительства РФ и освобождении его от должности руководителя Администрации Президента (его преемником на этом посту стал Сергей Собянин).

　　В мае 2006 года возглавил комиссию по развитию телерадиовещания.

　　Также, возглавляет попечительский совет "Фонда поддержки олимпийцев России".