Тибетская медицина отличается глубоким знанием анатомии и физиологии. По тибетской медицине в систему внутренних органов входят: сердце, печень, селезёнка, легкие, почки, толстый кишечник, тонкий кишечник, желудок, мочевой пузырь, желчный пузырь и т. д. В древние времена в тибетской медицине образно были описаны все внутренние органы. Например, сердце сравнивали с восседающим на троне королем. Оно находится в центре грудной полости. Легкие, как сановники и принц-наследник, расположились вокруг короля. Печень и желчный пузырь, как жена и наложница короля, находятся у него в ногах. Почки – это галереи, связывающие весь дворец, без них тело человека не может быть дворцом, в котором находятся король, сановники и жены.

　　В ходе лечения лекарственными средствами в тибетской медицине применяется метод, согласно которому сначала внутрь принимают подготовительную дозу лекарства. Например, принимают подготовительную дозу сахара для лечения лихорадки, а для лечения тифа в качестве подготовительной дозы служит коричневый сахар.

　　Кроме того, тибетская медицина имеет свой способ применения лекарств. Например, пилюли обычно запивают водой. Если болезнь обладает холодным характером – лекарство запивают горячей водой, а для лечения болезней с характером жара – наоборот, холодной водой. Для лечения смешанных болезней – лекарство принимают, запивая его теплой водой.