Озеро Баграшкёль расположено в у северного подножья хребта Куруктаг в Синьцзяне, что в 14 километрах от уездного города Карашар.

Последние геологические исследования показывают, что Карашарская впадина образовалась еще в период Тянь-Шань-Хайсиского тектонического движения. Что касается озера Баграшкёль, то озерная чаша образовалась на основе складчатости разлома поздний период мезозойской эры и последний этап третьего века.

Баграшкёль располагает довольно обширным водным пространством. Длина между восточным и западным берегом –55 км. Ширина между южным и северным берегом - 25 км. По внешности озеро напоминает треугольник, который занимает 1300 кв. км. Средняя высота водной поверхности над уровнем моря –1,048 метров. Тальвег озера – 1,031 метров над уровнем моря. Максимальная глубина воды – 16,45 метра. Средняя глубина воды – 9 метров. Средняя емкость резервуара – 8 млрд кубометров Нынешнее озеро делится на две части: большое озеро площадью в 980 кв км, и маленькое озеро площадью в 100 кв км. Вблизи маленького озера пруды и болота, покрытые камышом, их площадь – 300 кв км. Кроме того, в юго—западном направлении с востока на запад расположены группа мелких озер, их всего 13, их общая площадь – 240 кв. км.