В январе 2003 года пограничные войска Китая и России в пограничной провинции Хэйлунцзян провели совместные учения на тему задержания нелегально переходящих границу.

　　В январе 2004 года официально начали свою работу Секретариат ШОС и региональные антитеррористические структуры в Пекине и Ташкенте. ШОС разработала механизм регулярных встреч секретарей совещаний стран-участниц ШОС с целью укрепления сотрудничества в сфере охраны безопасности.

　　6 июля 2004 года заместитель председателя Центрального военного совета ЦК КПК Го Босюн и министр обороны РФ Сергей Иванов подписали Меморандум о китайско-российских совместных военных учениях.

　　В апреле 2005 года ШОС подписала с АСЕАН и СНГ Меморандум об артитеррористическом сотрудничестве. В июле на саммите в Астане была принята Концепция сотрудничества государств-членов ШОС в борьбе с терроризмом, сепаратизмом и экстремизмом.

　　18–25 августа 2005 года прошли китайско-российские совместные военные учения «Мирная миссия–2005», направленные на повышение боевой способности и эффективности в отношении новых вызовов и угроз. Учения не нацеливались против третьих стран. Данные учения проходили во Владивостоке РФ, в провинции Шаньдун КНР и морской акватории вблиз нее. Китай и Россия выделили около 10 тысяч военнослужащих, в том числе, 7000 участников с китайской стороны. Это были первые китайско-российские совместные военные учения, отличающиеся большим количеством предметов, трудностью в координации, сложностью в организационной работе. Сотрудники двух армий продемонстрировали высокие способности. Благодаря отличной подготовке, тщательной организации, тесной координации и непрерывной работе учения увенчались полным успехом. Учения показали высокую военную квалификацию и кадровую подготовку двух армий, а также практическую способность в совместном проведении военных действий высших командиров и командующих органов двух армий. В учениях войска проявили большую мужественность и твердость в боевой ситуации. «Мирная миссия-2005» стала высокоуровневым и высококачественным совместным военным учением. Генерал-полковник КНР Цао Ганчуань и генерал-полковник РФ Сергей Иванов присутствовали на церемонии закрытия военных учений и выступили с речью. Они высказали, что в дальнейшем будут проводиться новые совместные военные учения.