Куско был столицей великой Империи Инков, которая простиралась через все западное побережье и горную местность южноамериканского континента. Куско и его окрестности были первым поселением Инков в начале 13-го века. С того времени Инки расширяли свое королевство, а позже Империю завоеваниями и войнами. К Империи присоединялись другие королевства Южных гор, западного побережья, Северного побережья.