5 июля 2009 года в Урумчи произошли массовые беспорядки, спровоцированные и организованные силами "Восточного Туркестана", в том числе "Всемирным уйгурским конгрессом", в результате инцидента погибли как минимум 197 человек, более 1700 получили ранения.
Терроризм, экстремизм и сепаратизм названы китайским правительством "тремя силами зла" и рассматриваются как экстремальные силы, создающие угрозу государственной безопасности и стабильности Синьцзяна. МОБ КНР в 2003 и 2008 гг. дважды публиковало список двух групп террористов и 4 террористических организаций.
По словам бывшего секретаря Политико-юридической комиссии парткома СУАР Чжан Сюмина, в течение 2003-2007 гг. органами общественной безопасности Синьцзяна были обезврежены как минимум 117 террористических организаций и группировок.
При усилении борьбы с терроризмом в стране китайское правительство также активизирует международное сотрудничество в этой области. С 2002 года Китай с сопредельными странами провели 14 совместных антитеррористических учений. 9 сентября 2010 года в Казахстане начались новые антитеррористические учения "Мирная миссия-2010", подобные военные маневры проводятся в рамках ШОС уже в седьмой раз.
